蛋白质翻译后修饰（Post-translational Modifications, PTMs）是在蛋白质翻译完成后发生的一系列酶促共价修饰，如磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等。这些修饰调节着蛋白质的活性、定位、相互作用与降解，是维持细胞稳态和响应环境刺激的重要分子机制。然而，PTM的复杂性和动态性对检测手段提出了极高要求：

• 修饰位点往往低丰度、易降解；
• 多种修饰共存，且结构多样；
• 需要区分修饰的精确位置和类型。

在众多分析技术中，质谱（Mass Spectrometry, MS）因其高灵敏度、高通量和高分辨率，已成为研究PTMs的核心工具。特别是在与高效的修饰肽富集策略结合之后，质谱技术几乎可覆盖主流修饰类型的全面分析需求。

一、为什么选择质谱进行PTM分析？

1、离子化与碎裂：实现肽段级修饰识别

质谱通过将样本中的肽段离子化，并对其进行质量分析与碎裂扫描（MS/MS），可精确识别肽段的质量构成与修饰差异。

（1）母离子（MS1）：可判断肽段是否被修饰（质量增加）；

（2）碎裂离子（MS2）：可定位修饰的具体氨基酸位点。

2、高分辨质谱平台优势

当前主流的高分辨率质谱平台，如Orbitrap、timsTOF、Q-TOF系统，具备如下特性：

百泰派克生物科技配备的Orbitrap Exploris 480 与 Bruker timsTOF Pro 系统，能够覆盖常见修饰至特异低丰度修饰（如SUMO化、羟基化）在内的全谱检测需求。

二、质谱技术在主流PTM类型中的应用实践

1、磷酸化（Phosphorylation）

（1）富集策略：TiO₂、IMAC、Fe³⁺磁珠富集；

（2）质谱检测难点：修饰不稳定，易在离子化过程中失磷；

（3）解决方案：使用HCD或ETD碎裂技术稳定保留修饰；

百泰派克通过优化TiO₂ + DDA/DIA联合平台，在典型肿瘤细胞样本中可稳定定量识别超过10,000个磷酸化位点。

2、乙酰化与甲基化（Acetylation & Methylation）

（1）富集策略：修饰特异性抗体富集（anti-AcK、anti-MeR）；

（2）定量方式：TMT标记或Label-free；

（3）生物学意义：多用于研究染色质结构、转录调控、组蛋白修饰；

3、泛素化（Ubiquitination）

（1）识别标志：K-ε-GG残基特异性富集；

（2）质谱特点：MS2碎裂谱中识别特征性离子，可识别泛素链连接方式（K48, K63等）；

（3）研究用途：降解信号识别、E3连接酶功能研究。

三、质谱技术在PTM研究中的独特优势总结

四、百泰派克生物科技在PTM质谱研究中的服务能力

百泰派克生物科技深耕质谱与蛋白质组学领域，已构建起完整的PTM分析技术平台，具备如下能力：

• 多类型修饰富集流程库：支持磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化、糖基化、SUMO化等；
• 高分辨质谱平台矩阵：支持DDA、DIA、PRM、MS³等多种检测模式；
• 大规模项目支持能力：适用于临床队列、多组学整合、大数据挖掘项目；
• 一站式交付内容：包括修饰位点数据、蛋白定量结果、通路富集分析、图表输出；
• 定制化科研支持：支持SCI文章级数据交付、课题设计建议与技术共建合作。

翻译后修饰作为蛋白质功能调控的核心环节，是理解复杂生物系统不可或缺的窗口。质谱技术的引入，为这一领域带来了前所未有的分辨率与系统性。它不仅可以捕捉微量修饰的存在，还能揭示其在时空维度上的动态变化，成为PTM研究从“点”到“面”、从“识别”到“定量”的关键推动力。百泰派克生物科技将继续围绕质谱平台建设、修饰富集优化与数据分析标准化，助力广大科研人员深入揭示蛋白质翻译后修饰网络，推进精准医学与转化研究的发展。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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