Lexogen公司Spike-in RNA Variants (SIRVs)闪亮登场,助力RNA测序!-商家活动-资讯-生物在线

Lexogen公司Spike-in RNA Variants (SIRVs)闪亮登场,助力RNA测序!

作者:北京赛百盛基因技术有限公司 2016-10-21T15:29 (访问量:5093)

Lexogen公司Spike-in RNA Variants (SIRVs)闪亮登场,助力RNA测序!
SIRVs - Spike-in RNA Variant Control Mixes


作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与治疗领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精准信息。分子量标准和对照是唯一可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量。


优势:
§ 69种转录物,分别代表了可变剪接,启动子,poly(A)位点的使用,重叠基因和反义转录
§ 3种不同的混合物,用以评估浓度和差异表达测量值的准确性
§ 在可信条件下,实现工作流程和实验的在线验证
§ 用于比较转录组测序实验的通用标准


工作原理
SIRVs是根据7个人类基因结构设计而成的,其中每个基因结构有6-18种转录物变异,因此总共有69种转录物。这些转录物全面的解决了可变剪接,可变转录起始点和末端,重叠基因和反义转录问题(图1)。在RNA提取或文库构建的起始阶段加入SIRVs,待研究RNA的终浓度控制在1-2%。SIRVs的数据评估可以用来判定数值的准确性和精准度,从而揭示每个已处理样本特定的技术噪音。


图 1 | SIRVs的设计概览。SIRV基因模拟人类模式基因,大量的重复与变异的存在使SIRV基因代表了可变转录的所有主要方面。A5SS和A3SS:可变5'/3'剪接位点; MXE:互斥外显子 。

SIRVs试剂盒提供一组试剂,由三种不同混合液(E0, E1, E2)组成。每种混合液由4种不同浓度的亚混合液组成。E0混合液保持等摩尔的SIRV浓度,而E1混合液和E2混合液的最大浓度差分别是8倍和128倍。3种混合液之间的浓度的比率从1/64到16变动(图2)。

图2 | 4种亚混合液(1-4)在3种SIRV混合液(E0, E1, E2)中分布的图解示意及相应的混合液内和混合液间的浓度比率。4种亚混合液用不同颜色代表。每种混合液还有12到21种SIRVs,从而保证混合液的总摩尔浓度和重量平衡在69 5 fmol/μl和25.3 ng/μl的水平。左图是混合液内部的浓度比,3种混合液有3种不同的比例设定,用于评估相对浓度测量值的准确性。右图中,预设的倍数变化用于3种可能的混合液间组合(两两混合)的比对,从而评估差异基因表达的测量值。
详细英文信息请浏览 https://www.lexogen.com/sirvs/

目录号:Cat. No. 025.03
报 价:15,000元人民币

网络研讨会:
Lexogen公司将于2016年10月19日举行SIRVs的产品网络研讨会。Lexogen公司的服务主管Lukas Paul将主持此次的研讨会。我们的主题是"用Spike-In RNA Variants调控转录组测序实验(Controlling RNA-Seq Experiments Using Spike-In RNA Variants)"研讨会相关的摘要和注册信息请点击下面的链接查看。
https://www.labroots.com/ms/webinar/controlling-rna-seq-experiments-using-spike-in-rna-variants

相关科研奖励:
Lexogen公司设立了Lexogen研究奖励 — "用Spike-In RNA Variants调控转录组测序实验(Controlling RNA-Seq Experiments Using Spike-In RNA Variants)"。在这项奖励中,我们邀请科研学者们提交包含NGS和SIRVs的项目提案。我们会赠与三名评选出来的获胜者一套SIRVs试剂盒以及运行一次测序程序的机会。此外,我们还为那些因为不从事转录组测序研究或没有可提交的项目提案的学者们提供了"推荐项目"。

详情请参见网址: https://www.lexogen.com/award-2016-2/



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